Сотрудник ГИБДД забрал карту сд с регистратора и потерял. Что делать?

Обращаться в СКР, жаловаться в прокуратуру. Ущерб взыскивать с МВД РФ в судебном порядке.

Обращаться в Прокуратуру и взыскивать в судебном порядке.

Писать жвлобу вышестоящему руководству. .основания забора? Есть ли протокол изъятия?

В данном случае надо зафиксировать факт, что он забрал. Если изъяли и у вас копия, то нормально. Если просто забрал, то пишите в прокуратуру пусть опросят, что пояснит.