В квартире где прописан муж собственник его отец имеет ли там долю моя дочь как единственная наследница после смерти мужа

Пока нет

Да - при отсутствии завещания.

Придётся дождаться не только смерти мужа, но и его отца. Тогда ваша дочь получит статус наследницы.

После смерти мужа его дочь имеет право на всё имущество которое находилось в собственности её отца.

вы же сами пишете что квартира принадлежит отцу мужа ,поэтому у него ничего нету ,наследовать-то нечего, поэтому непонятно о какой доли речь идёт.