1. В арбитражном суде
В соответствии с п. п. 1.8 - 1.10 Приказа Судебного департамента при Верховном Суде РФ от 05.11.2015 N 345 возврат денежных средств с депозитного счета арбитражного суда производится на основании письменного заявления плательщика с указанием реквизитов лицевого (расчетного) счета в течение 30 (тридцати) дней с момента подачи такого заявления.
2. В суде общей юрисдикции
Если на счет судебного депозита были перечислены деньги не в том порядке или в неправильном размере, то лицо имеет право на их возврат. Для этого необходимо написать заявление о возврате в суд, в котором указать основание возврата и предоставить сведения о переводе средств.
В случаях получения судебного решения в свою пользу, лицо имеет право на возврат депозитных средств на основании заявления.
Удачи.