Я собственник жилья, но у меня в паспорте нет стоит что я там прописан, будет ли за это штраф?

Нет, не будет, у Вас нет такой обязанности

Нет

А с чего? По закону допустимы собственники без регистрации.

Нет, за это не будет штрафа. Человек может иметь в собственности жилье, но быть прописан он там не обязан. Главное это просто иметь постоянную регистрацию, а где - это уже неважно. Вот за проживание вообще без регистрации полагается штраф в размере от 2000 до 3000 руб.

Просто осутствие штампа в паспорте создаст неудобства в тех случаях, когда надо будет подтвердить адрес вашей регистрации по месту жительства.

В паспорте наличие паспорта необязательно. Штрафа не будет.