Имеют ли право отказать мне в приеме в женской консультации не по прописке, а по факту проживания.

Сначала нужно прикрепиться к жк по месту пребывания.

Для этого достаточно написать заявление на имя главного врача. Причем медицинское учреждение можно выбрать по месту фактического проживания или рядом с работой. Отказать в постановке на учет, если есть полис ОМС, не имеют права.