Если с вами заключен трудовой договор, ваши трудовые отношения подпадают под действие Трудового кодекса Российской Федерации, следовательно, должны оплатить.
Больничный оплатят в любом случае, поскольку болезнь наступила в период вашей трудовой деятельности, при условии Конечно если вы оформлены официально по Трудовому договору.