Здравствуйте! Это необходимо уточнить у Вашего работодателя.Посмотрите внимательно какие коды доходов указаны и получали ли Вы их.
Добрый день, наверно потому, что у вас официальная часть заработной платы которая идет на уплату налога и неофициальная часть. С неофициальной части удерживать НДФЛ не должны, но возможно из-за вашей неграмотности Вас обманывают.