Возможно ли вернуть неустойку 3% через суд, если ЖКХ не принимает в расчет оплату за два месяца, судом доказанную?

Да, требуйте с неустойкой.

Добрый день, прежде всего необходимо отправить до судебную претензию, в которой вы попросите принять в расчет произведенную оплату за два месяца. К Претензии приложите также документы на которые вы ссылаетесь (квитанции или Решение суда, если вы говорите, что судом это было доказано). В Претензии указываете срок в 10 дней для удовлетворении претензии, согласно статьям 22 или 31 Закона РФ от 07.02.1992 г.№2300-1 "О защите прав потребителей". В случае, если они никак не отреагируют или пришлют письмо с необоснованным отказом вы спокойно можете обратиться в суд с указанными требованиями о неустойки, моральном вреде и штрафе, согласно Закону РФ от 07.02.1992 г.№2300-1 "О защите прав потребителей".