Сын от первого брака не является наследником квартиры. Отец подал документы на наследство, но сын так и не появился у нотариуса. Возможные проблемы для отца и последствия отсутствия сына.

никаких проблем. Сын, если был с мамой зарегистрирован на день ее смерти, получит свою долю в любой момент, на него не распространяется срок 6м со дня смерти. На всю квартиру вашему папе не дадут св-во о праве .

PS сын от 1 брака принял наследство с первой секунды смерти матери

Если сын вместе с матерью не проживал в ее квартире, то одна только регистрация еще не является фактическим принятием наследства. Если сын не обратится к нотариусу до окончания срока принятия наследства, нотариус обязан выдать свидетельство о праве на наследство тем наследникам, которые наследство приняли (подали заявление в установленный срок).

Проблемы могут быть в виде попытки сына доказать в суде фактическое принятие наследства либо восстановить пропущенный срок, а значит и оспорить выданное отцу свидетельство о праве на наследство.