Работаю в супермаркете. Пришли непонятные люди сняли отпечатки у всех сотрудников без объяснений. Законно ли это?

Это незаконно, отпечатки снимать никто не имеет право без Вашего согласия, за исключением случаев задержания Вас по подозрению в совершении преступления.

Нет, подобные действия недопустимы и незаконны.