Как выписать ребенка из квартиры, если отец прописан, но не является собственником и собственник не соглашается на прописку ребенка?

Снятие с регистрационного учета несовершеннолетнего процедура сложная, здесь необходимо учитывать все обстоятельства дела и в первую очередь интересы самого ребенка. Согласно ст. 20 ГК РФ местом жительства детей не достигших 14 лет считается место жительство одного из родителей. Поэтому суд всегда исходит из таких обстоятельств, как фактическое проживание в жилом помещении ребенка и родителя, в практике имеют место быть случаи, когда ребенок фактически не проживает длительное время в спорном помещении а проживает по другому адресу вместе со своими родителями, то принимаются решения о признании несовершеннолетнего не приобретшим право проживания в жилом помещении и снятии его с регистрационного учета, однако если ребенок фактически проживает в квартире, то снять его с учета не получится

Согласия собственника не требуется. Выписать практически невозможно.

Только в судебном порядке и только вместе с отцом.