Обязательно ли участие конкурсного управляющего в Арбитражном суде при банкротстве ИП?

да, обязательно. Обратите внимание на Пленум ВАС РФ в Постановлении от 30.06.2011 N 51, который дал разъяснения нижестоящим судам о применении положений Федерального закона от 26.10.2002 N 127-ФЗ "О несостоятельности (банкротстве)" в рамках дел о банкротстве индивидуальных предпринимателей.