Вопрос о возможности открытия ИП в Нижнем Новгороде для гражданки Литвы

Да можете. Иностранные граждане, постоянно или временно проживающие на территории России, вправе зарегистрироваться в качестве ИП. Но регистрация таких лиц возможна только при наличии разрешения на временное проживание на территории РФ или вида на жительства.