Уважаемый Василий!
В Вашей ситуации, основные применимые нормы ст. 149 ГК РФ; п. 5 Положения о ведении реестра владельцев именных ценных бумаг, утвержденного Постановлением ФКЦБ России от 02.10.1997 N 27
Пункт 5 Положения о ведении реестра предусматривает основания и порядок аннулирования записи в реестре акционеров, однако, несмотря на это, в судебной практике возникают споры о надлежащих основаниях для осуществления данного действия.
С 01.10.2013 вступили в силу изменения, внесенные в гл. 7 ГК РФ Федеральным законом от 02.07.2013 N 142-ФЗ. Данные изменения применяются к правоотношениям, возникшим после указанной даты. По ранее возникшим правоотношениям изменения применяются к тем правам и обязанностям, которые возникнут после 01.10.2013.
В соответствии с п. 2 ст. 149 ГК РФ (в ред. Закона N 142-ФЗ) учет прав на бездокументарные ценные бумаги осуществляется путем внесения записей по счетам лицом, которое действует по поручению лица, обязанного по ценной бумаге, либо лицом, которое действует на основании договора с правообладателем или иным лицом, в соответствии с законом осуществляющим права по ценной бумаге. Согласно п. 3 указанной статьи распоряжение, в том числе передача, залог, обременение другими способами бездокументарных ценных бумаг, а также ограничение распоряжения ими могут осуществляться только посредством обращения к лицу, которое осуществляет учет прав на бездокументарные ценные бумаги, для внесения соответствующих записей.