Микроорганизация - это ООО?

ООО - это организационно правовая форма. Микроорганизация может быть в форме ООО и ЗАО.

Если вы имеете в виду микрофинансовые организации, то они могут быть в следующих организационно-правовых формах: фонд, автономная некоммерческая организация, учреждение, некоммерческое партнерство, хозяйственное общество (ООО, ЗАО, ОАО) или товарищество.