Могут ли депортировать гражданина Таджикистана если он женат на русской?

Если он нарушит режим пребывания в РФ, то к нему помимо штрафа могут применить административное наказание в виде административного выдворения из РФ.

Конечно могут, если он нарушает правила пребывания. Брак с россиянкой не помеха для таких действий. Надо заниматься вопросом получения гражданства.