Я 100% собственник. Директор наемный. Могу ли я подать заявление о банкротстве.

Заявление подается исполорганом юрлица, в Вашем случае это директор. Вы, как единственный участник, при наличии признаков банкротства можете принять решение о подаче заявления о банкротстве. Такое решение носит обязательный характер для директора. В случае несогласия директора с данным решением Вы можете принять решение о назначении на должность директора другого лица. Можете себя назначить директором.