Можно ли подать заявление о регистрации ИП в любой налоговой инспекции Красноярска и края, если прописка в мотыгинском районе?

Взять заявление (бланки), Вы конечно можете, но вот сам регистрация гражданина в качестве ИП осуществляется по месту его жительства. Местом жительства гражданина РФ является жилое помещение, в котором гражданин постоянно или преимущественно проживает (Закон РФ от 25 июня 1993г. N 5242-1 "О праве граждан Российской Федерации на свободу передвижения, выбор места пребывания и жительства в пределах Российской Федерации")

Согласно этому же закону, человек должен быть зарегистрирован по месту своего проживания.

Значит в качестве ИП Вы сможете зарегистрироваться в налоговой по месту своей регистрации, т.е. в Мотыгинском районе