Что делать, если главный бухгалтер находится под следствием, но продолжает работать?

Нахождение под следствием не является основанием для отстранения от работы, кроме случаев, назначения меры пресечения , предполагающего ограничение свободы.

Обратитесь с соответствующим обращением к исполняющему обязанности руководителя организации, он вправе принять решение в соответствии с трудовым законодательством. Если в период предварительного следствия следователь принял решение не отстранять бухгалтера от занимаемой должности, значит не было на это оснований.