Можно ли поставить штамп о гражданстве РФ ребенку 12 лет без паспорта отца?

Да, поставить штамп о гражданстве РФ ребёнку 12 лет можно без паспорта отца, если предоставить документы, подтверждающие статус единственного родителя. Это может быть решение суда об установлении отцовства, решение суда о лишении отца родительских прав, либо справка из органов внутренних дел о том, что местонахождение отца неизвестно.

Если отец не лишен родительских прав, то для постановки штампа о гражданстве ребенку, потребуют в МВД копию паспорта второго родителя.

Как вариант, если есть на него исполнительное производство по алиментам, взять копию паспорта у пристава в материалах исполнительного производства.