Можно ли военнослужащему сво наисать рапорт через военную комендатуру не ехав в часть?

Написать - можно всегда. Но если ехать надо - такое отправление не прекращает обязательство ехать.

Нет. Рапорт на имя командира части, уволиться можно только по здоровью или по предельному возрасту.