Может ли работодатель оплатить учебный отпуск, если предоставлена справка за 2 недели до окончания трудового договора?

Нет. На момент ухода в учебный отпуск вы уже не будете являться сотрудником, поэтому вам его не оплатят.

Справку-вызов из учебного заведения для оформления учебного отпуска рекомендуется принести заранее, желательно за две недели до начала учёбы, чтобы у работодателя было время издать приказ и выдать отпускные.

Конкретных указаний по этому поводу и сроков в законе нет, хотя всё же в интересах работника сделать это до начала отпуска. Исключение по срокам есть только для сотрудников, допущенных к защите кандидатских или докторских диссертаций: они должны уведомить начальство о своём желании уйти в учебный отпуск как минимум за год до его начала и принести несколько дополнительных документов.

Работодатель обязан оплатить учебный отпуск не позднее чем за три дня до его начала (ч. 9 ст. 136 ТК РФ).