Вопрос о возможности наймодателя содержать квартирантов в муниципальной квартире и уплачивать налоги в соответствии с новыми законами

Только он не наймодатель, а наниматель. И сдать может в поднаём, с согласия Департамента жилищной политики, если позволяет размер жилья.

Статья 76 ЖК РФ. Поднаем жилого помещения, предоставленного по договору социального найма

1. Наниматель жилого помещения, предоставленного по договору социального найма, с согласия в письменной форме наймодателя и проживающих совместно с ним членов его семьи вправе передать часть занимаемого им жилого помещения, а в случае временного выезда все жилое помещение в поднаем. Договор поднайма жилого помещения, предоставленного по договору социального найма, может быть заключен при условии, если после его заключения общая площадь соответствующего жилого помещения на одного проживающего составит не менее учетной нормы, а в коммунальной квартире - не менее нормы предоставления.

Учётная норма для отдельных квартир - 10 кв.м. общей площади на человека.