Выплатит ли мне налоговая 13 процентов с продажи комнаты стоимость которой 900000

Елена, с продажи Вы должны выплачивать налоговой, а с покупки Вы имеете право сделать налоговый вычет.

С уважением, Князева Анастасия

Налоговая обычно взыскивает/удерживает налоги и Вам она ничего выплачивать не будет.