Как правильно оформить выход и уволиться в такой ситуации?

Участник считается вышедшим с даты подачи заявления о выходе участника ООО, при этом обязанность по регистрации изменений в ЕГРЮЛ лежит на обществе. Регистрационные действия должен выполнить Генеральный директор, именно поэтому является он является заявителем при выходе участника.

В отличие от других сотрудников директор должен предупредить работодателя о своем намерении не позднее, чем за один месяц (ст.280 ТК РФ). Согласия работодателя не требуется. Вам необходимо предупредить за месяц общее собрание учредителей. Если таковое не собирается, отошлите заявление на увольнение заказным письмом. Имея на руках доказательства направления каждому участнику общества заявления об увольнении, директор после истечения срока предупреждения об увольнении на основании ст. 80 ТК РФ может прекратить работу. Его увольнение считается состоявшимся.