Делайте, как вам сказал суд.

Неправильное утверждение. Госпошлины оплачивается исходя из стоимости спорного имущества. Согласно ст. 91 ГПК РФ цена иска определяется:

9) по искам о праве собственности на объект недвижимого имущества, принадлежащий гражданину на праве собственности, исходя из стоимости объекта, но не ниже его инвентаризационной оценки или при отсутствии ее - не ниже оценки стоимости объекта по договору страхования, на объект недвижимого имущества, принадлежащего организации, - не ниже балансовой оценки объекта.

Сложно комментировать ответ суда, не видя Вашего иска и текста определения об оставлении без движения. Цена иска по спорам о признании права собственности на недвижимость согласно ст. 91 ГПК РФ определяется стоимостью недвижимости (1/2 доли в Вашем случае). Но что именно происходит у Вас поймет только тот, кто видел документы. Рекомендую обратиться к юристу на индивидуальную консультацию.