Сомнительная справка НДФЛ - подтвердит ли она доходы должника?

Да, именно так. Если сумма в справке НДФЛ существенно меньше, чем в сведениях с пенсионного фонда, то это может быть доводом для предположения о том, что должник имеет доходы, которые не облагаются налогами.