В соответствии с п. 2 ст. 346.17 НК РФ расходами
налогоплательщиков признаются затраты после их фактической оплаты.
При договоре мены каждая из сторон признается продавцом товара,
который она обязуется передать, и покупателем товара, который она
обязуется принять в обмен. При получении имущества в счет оплаты
переданного имущества происходит процесс его реализации.
Следовательно, организация получает доход от реализации, который
учитывается для целей налогообложения в соответствии со ст. 346.15 НК
РФ. Одновременно осуществляется оплата приобретенного имущества. Таким
образом, затраты учитываются при исчислении налоговой базы по единому
налогу на основании пп. 1 п. 1 ст. 346.16 НК РФ.
Как следует из Вашего вопроса, обмен объектами
недвижимости (нежилыми помещениями) произведен по равноценной стоимости.
Следовательно, стоимость приобретенного нежилого помещения при
определении налоговой базы по налогу, уплачиваемому в связи с
применением упрощенной системы, не учитывается.