Ошибка в количестве материала - как исправить смету и не расторгнуть контракт?

Прежде всего - такой вопрос может быть разрешен только при наличии согласия обеих сторон. В одностороннем порядке разрешить его не удастся без расторжения или урегулирования в т.ч. в судебном порядке.

Если есть согласие обеих сторон, то необходимо изучить все обстоятельства и только потом возможно принятие того или иного решения. В противном случае не исключена ошибка, которая повлечет неблагоприятные последствия как для одной, так и для другой стороны.

В рамках короткий вопрос - короткий ответ получить обоснованное решение невозможно. В подобных ситуациях не бывает "волшебной" таблетки.

Уточняю. Ошибку совершил сотрудник Заказчика, который готовил документацию к тендеру. Возможно ли решить этот вопрос отпавшими и дополнительными работами, плюс/минус. С составлением дополнительного соглашения в конце работ. Юристы заказчика настаивают, что в рамках 44-ФЗ возможно только одно такое доп. соглашение.