Как разделить и оформить дом после развода, который был достроен не оформленной постройкой?

Правильно это заключить соглашение о разделе имущества. В случае невозможности такого соглашения-обратиться в суд с иском о разделе имущества по 1/2 доли.

А когда он был вам подарен вы его в долях оформляли?

В любои случае надо вводить новый дом и регистрировать его в росреестре.

Либо но нотариальному соглашению либо в судебном порядке.

По общему правилу имущество, подаренное одному из супругов, второму не принадлежит. Вместе с тем, если в период брака в принадлежащее одному из супругов имущество были произведены значительные вложения, существенно увеличившие его стоимость и являющиеся неотделимыми, то в этом случае второй супругу вправе поставить вопрос о выделе ему доли, либо соответствующей денежной компенсации. Окончание оформления постройки, решающего значения не имеет.