Важно ли правильно указывать отчество в договоре купли-продажи для постановки на учёт?

Да, могут быть, необходимо переделывать договор.

"Отчество" в договоре, это не единственный идентифицирующий признак, субъекта правоотношений, там должны быть и паспортные данные. Но делая ссылку на крючкотворство работников росреестра, то лучше договор переделать или установить ошибку в судебном порядке.