Может ли председатель садоводческого товарищества прокладывать трубу через чужой участок для полива?

Здравствуйте! Нет, не может. Своими действиями он нарушает ваши права. Можно обратиться с претензией или в суд с исковым заявлением об устранении препятствий в пользовании земельным участком.

На самом деле теоретически может, если это согласие Вы уже выражали, подписывая документы СТ, в которых оговорена такая возможность. Если не оговорена нигде - тогда без Вашего согласия не может.