Хочу продать ипотечную квартиру, прописано двое детей, доли на них нет, ипотека выплачена.

Получите разрешение органов опеки и продавайте.

Нет проблем, ищите покупателя, выписывайтесь вместе с детьми и заключайте договор купли-продажи. Согласие отдела опеки не требуется.

Ну раз выплачен кредит, то причем тут "ипотечная квартира"?

Продавайте, детей снимайте с учета.

И органы опеки вообще тут не причем.. и никакого разрешения от них не нужно.

Марина, если Вы не использовали при погашении кредита материнский капитал, тогда можете продавать квартиру, разрешение органов опеки вам не требуется ни на продажу, ни на снятие детей с рег учета.

Естественно, после выплаты кредита нужно было снять в реестре обременение (ипотеку). Если вы еще этого не сделали, обратитесь в ваш банк.