Что мне грозит? Не хочу регистрировать дом на зарегистрированном участке в снт.

Грозит ответственность за неуплату налога на имущество с физических лиц.

Пока Вы дом не зарегистрировали угрозы возникновения необходимости платить налог не возникает, только за участок.

Вам могут не согласовать договор по обеспечению электричеством.

А так ничего серьёзного.