Как получить помощь от государства на ипотеку при рождении третьего ребенка, если было использовано право на материнский капитал за второго?

В соответствии с Постановлением Правительства Российской Федерации от 07.09.2019 № 1170.

Реструктуризация, рефинансирование, допущенные просрочки по оплате ипотечного долга, использование материнского капитала или иных льгот — ничто из перечисленных действий не является причиной для отказа в получении субсидии.

ДА, в вашем случае вы в праве рассчитывать на субсидию для погашения ипотечного кредита.