Нужно ли выделять долю в жилье, купленной за материнский капитал, если супруг не является отцом детей.

Если на момент распоряжения средствами МК в браке не состояли, то нет, не нужно.

Если вы приобрели жилье на материнский капитал, вы имеете право выделить доли только детям и себе. Ваш супруг не отец детей не имеет к этому никакого отношения.

Не понятен вопрос, кому вы хотите выделить долю.