Может ли муниципальная администрация, снести гараж зафиксированный в техпаспорте на дом?

Может, но если в рамках закона, то при наличии Вашего согласия на это, либо судебного решения, разрешающего ей это сделать.

То что он зафиксирован в тех паспорте, означает только то что он на момент инвентаризации был возведён, это не влечёт никаких прав на него, однако если вы построили го на своём участке с соблюдением законодательства, то оснований для сноса нет.