Ребенок два раза не сдал историю, что теперь делать?

Логичным ответом конечно было бы: учить историюи пробовать в следующем году. Но если Вы предполагаете, что имеет место неправильный подсчет результатов на ЕГЭ или ОГЭ здесь Вы можете подать апелляцию https://www.mos.ru/services/podat-apellyatsiyu-na-rezultaty-gia/

или выбрать ВУЗ где история не нужна.