Проблемы с кадастровым номером и налогом при продаже реконструированного дома

Оформили реконструкцию дома, через суд. Когда отдали документы на изменение кадастрового паспорта, выяснилось что у нас на дом задвоеный кадастровый номер. Нам присвоили новый кадастровый номер, и вдруг выясняется что после продажи мы должны заплатить налог на прибыль, якобы мы пользовались домом менее 3-х лет и обязаны заплатить налог. Хотя домом владеем более 10 лет. Вкладывали в него свои деньги отстраивали, но решили разъехаться продав дом.