Как быть если налоговая инспекция подала на меня в суд ошибочно, и теперь с меня требуют оплатить госпошлину за суд?

Госпошлина может быть оплачена ответчиком по решению суда. Исходя из Вашего вопроса Вы не являетесь ответчиком, поэтому госпошлину платить не обязаны.