Как снять запрет на регистрацию недвижимости в Росреестре, если должнику принадлежит доля в доме и это его единственное жильё?

В судебном порядке - обжаловать действия пристава.

Запрет вы не снимете. Верховный суд разрешил наложение запрета на единственное жилье. Пока не будет закрыто ИП, запрет будет действовать.