Здравствуйте.
В системе МВД вы работали как вольнонаемный, т.е. не были отсоветованным сотрудником, потому в стаж в ФСИН, работа в МВД не зачитается. Вот если бы Вы были аттестованным сотрудником, то тогда стаж за считался.