Кто - я или администрация рынка - должен заключить договор с подрядчиком?

Поскольку гражданским законодательством прямой договор, который бы регулировал такие отношения, не поименован, то весьма велик риск признания такой сделки недействительной, ничтожной или риск ее переквалификации на сделки, предусмотренные ГК РФ. Под инвестиционную деятельность Ваши вложения тоже не подпадают. Возможен вариант создания простого товарищества сроком до достижения целей товарищества. Либо это может быть смешанный договор, содержащий в себе элементы договора целевого займа и предварительного договора аренды недвижимости в будущем на срок 5 лет. Либо договор целевого займа с последующим заключением договора новации долга.

В качестве обеспечения исполнения обязательств можно использовать залог ликвидного имущества ООО и/или личное поручительство директора ООО (последнее маловероятно).