Работодатель отправляет в командировку моего мужа спустя две недели после рождения ребенка.

Формально отказаться от командировки нельзя в связи с тем, что это является неисполнением трудовых обязанностей.

Можно попытаться взять отпуск без сохранения заработной платы, согласно ст.128 ТК РФ, семейные обстоятельства, либо воспользоваться частью ежегодного оплачиваемого отпуска в порядке ст.125 ТК РФ.