Заявление на РВП нужно подавать в любом городе, где вы собираетесь проживать, если вы получаете РВП в одном регионе. ЭТо не имеет существенного значения.
Не где угодно. Там где вы сейчас проживаете, там вам и нужно подавать документы на РВП. По месту регистрации супруги на РВП вы подаете только в том случае, если собираетесь там жить.