Не нужно было этого делать. Ваш работодатель должен был самостоятельно заключить договор на на оплату медосмотров и сам оплатить его. Выглядеть это должно так - берете направление в своей организации, в медучреждении находят но названию вашей организации договор, уже заключенный на медосмотры работников, и впоследствии включают ваш медосмотр в счет для оплаты вашей организацией. Если у вас бюджетная организация - никакой компенсации не получите в случае самостоятельной оплаты. Разве что суд обяжет, да и то вряд ли. Вас же обвинят. Скажут, мол, сама виновата, зачем-то пошла оплачивать, а у нас всё оплачено - иди и проходи.
Доброго времени суток! Работодатель имеет право отказать в оплате медосмотра, потому что прошло более двух лет, затраты принимаются в период оплаты.