Могу ли я прописаться к своей жене в муниципальную квартиру если у нее есть долг по квартплате?

Долг не влияет на регистрацию по месту жительства. Отказ будет неправомерен

Она может вас вселить с согласия наймодателя. Наймодатель имеет право вам отказать во вселении, если в связи с вашим вселением общая площадь помещения окажется меньше учетной нормы.