Проблемы с отправкой документов о выходе в декрет в главный офис - что делать?

Как только Вам откроют листок нетрудоспособности, поставьте работодателя перед этим фактом и отправляйтесь в отпуск по беременности и родам. Непредоставить Вам этот отпуск никто не имеет права. Вас не уволят по инициативе администрации, поскольку Вы:

- беременны,

- временно нетрудоспособны.

Организация документооборота и своевременность доставки документов и принятия решений по ним - это проблема работодателя, а не Ваша проблема.

Работодатель должен вам предоставить отпуск на основании поданного заявления.

"Трудовой кодекс Российской Федерации" от 30.12.2001 N 197-ФЗ (ред. от 30.12.2015)

ТК РФ, Статья 255. Отпуска по беременности и родам

Женщинам по их заявлению и на основании выданного в установленном порядке листка нетрудоспособности предоставляются отпуска по беременности и родам продолжительностью 70 (в случае многоплодной беременности - 84) календарных дней до родов и 70 (в случае осложненных родов - 86, при рождении двух или более детей - 110) календарных дней после родов с выплатой пособия по государственному социальному страхованию в установленном федеральными законами размере.

(в ред. Федерального закона от 30.06.2006 N 90-ФЗ)

(см. текст в предыдущей редакции)

Отпуск по беременности и родам исчисляется суммарно и предоставляется женщине полностью независимо от числа дней, фактически использованных ею до родов.