Почему официально не работающий, платит в три раза большую сумму алиментов, чем человек официально работающий?

Не к нам вопрос, а к законодателям.

Ели Вы имеет сумму алиментов назначенную в фиксированном размере, то она определяется от прожиточного минимуму в регионе и может быть назначена и работающему плательщику алиментов

Такой закон. Устройтесь официально и будете платить меньше.