Теперь поняла. Вычет уже сделали в налоговой, но долг все равно остался большой.

«Он платится с разницы между ценой продажи старой квартиры и ценой покупки новой.» Простите, не понимаю. Цена продажи старой - 5 950 млн Цена покупки новой - 5 050 млн Разница 900 тысяч, и с них налог. Получается, что они как раз правы, а налоговая нет.